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公務(wù)員期刊網(wǎng) 精選范文 生物信息學培訓范文

生物信息學培訓精選(九篇)

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生物信息學培訓

第1篇:生物信息學培訓范文

2010年夏,我們單位參加無錫市疾控錢云老師組織授課的該項目師資培訓班后,返回社區(qū),選擇群眾基礎(chǔ)較好的陽山社區(qū),針對實際,精心準備,并結(jié)合高血壓、糖尿病兩大慢病為具體切入點,開展了《高血壓、糖尿病等慢病自我管理技能推廣培訓》講座。在內(nèi)容編排上作了增減,一方面加進了高血壓、糖尿病的有關(guān)健康科普知識,使講座更具實用性和說服力。另一方面,對講座中有些一時難以為基層居民理解接受的知識作了選擇梳理,從而保證了大家在短時間內(nèi)接受體驗慢病知識的實效性。反饋表明,我們帶來了一種新的醫(yī)療理念,一種新的慢病應(yīng)對思維,取得了預(yù)期效果。

陽山是著名桃鄉(xiāng),根據(jù)居民隨陽山水蜜桃種植特殊性多有起居早晚、忙閑不定這一特點,及中老年人慢病特點,在授課時,我們以講解為主,穿插講一些居民身邊的活生生的失敗或成功的病例,讓大家從具體案例中體會到慢病管理的重要性和益處,吸取教訓,改進不足,做得更好。在課件中,具體加進了目前CDC重點關(guān)注之“高血壓、糖尿病”兩大慢病的健康科普知識與“和平共處原則”,如何管理,如何服藥,什么是它們的應(yīng)急狀況、必須立即醫(yī)療干預(yù)等等。結(jié)合一些桃農(nóng)的疑問:為什么賣桃子的時候不覺得累,賣過了,閑了,反而覺得累,要生病?我們就試著利用祖國的中醫(yī)中藥知識,用王琦教授的“9種體質(zhì)相”理論跟他們解釋:什么是陰虛體質(zhì),陰虛的人為什么不覺得累,怎么調(diào)理等等。針對居民關(guān)注的一些具體健康問題如整體健康自評、健康擔憂、疲勞、氣短、疼痛、失能、情緒低落及社會活動/角色受限等,我們也按培訓要求做了簡單扼要的闡述,并讓大家互動,互相交流應(yīng)付慢性不適的經(jīng)驗與體會,讓學員互相學習,取長補短,共同體驗和戰(zhàn)勝疾病痛苦。針對失眠患者,我們教他們怎樣有效助眠、不拒絕助眠藥,并用季羨林大師和身邊一些長壽者的實例,解開他們的的困惑。針對各種疼痛,我們也提出了一些可以試試的緩解方法,如冥想、太極,適當參與麻將、撲克等民間娛樂,尤其如參與陽山地區(qū)群眾基礎(chǔ)較好的健身舞、門球、爬山等鍛煉活動。課后,一些居民由衷感慨道:原來看病可以這么看,原來我們可以與慢病和平共處。

我國的醫(yī)療體制雖然正在轉(zhuǎn)型,但由于國情所致,在解決一些慢性病問題時,醫(yī)療干預(yù)所起作用有限、且費用昂貴已成詬病,又由于慢性病人的預(yù)防性干預(yù)和衛(wèi)生保健活動通常都必須長期在社區(qū)和家里執(zhí)行,單純的醫(yī)療行為可操作性和可持續(xù)性均有不足。慢性病已成為我國多數(shù)地區(qū)的主要健康問題之一,隨著我國人口老齡化的加劇,慢性病者患病的絕對數(shù)和相對數(shù)更將日益增加。這些均是客觀存在的事實。而通過這次交流傳播,我們體會到,該技能的推廣培訓的確可以讓一部分社區(qū)居民學會自我管理,解決一些健康問題和慢病困擾。

第2篇:生物信息學培訓范文

關(guān)鍵詞:個性化習題;生物信息學;QQ群

中圖分類號:G811.4 文獻標志碼:A 文章編號:1674-9324(2016)48-0171-02

生物信息學是生物學、計算機科學和信息技術(shù)等支持的,包括存儲、組織和生物數(shù)據(jù)檢索的一個現(xiàn)代交叉學科。隨著分子生物學和信息技術(shù)的不斷突破,各種生物數(shù)據(jù)的獲得變得非常容易,但是如何對這些數(shù)據(jù)進行組織、分析和處理,并從中發(fā)掘出能用于解決生物科學問題的信息,成為目前生命科學的難點和熱點。生物信息學因此應(yīng)運而生,其本身不僅是研究現(xiàn)代生物學,也是研究其對工業(yè)、醫(yī)療等重要領(lǐng)域影響的一門實踐性學科(Bloom,2001)。

一般認為,生物信息學主要滲透到統(tǒng)計數(shù)學、計算機和生命科學,尤其是生命科學的組學領(lǐng)域(郭麗等,2014),因此在教學中,生物信息學的教學內(nèi)容往往因?qū)W生背景不同而會有不同的側(cè)重。這就需要教師根據(jù)學生的背景及知識結(jié)構(gòu)的需求來合理安排教學。本文根據(jù)近年來對生物信息學教學的經(jīng)驗,從教學方法、個性化練習題對學生上機的促進及QQ群投票功能在教學中的應(yīng)用等方面進行了總結(jié),對如何能夠提高生命科學學院的學生學習此門課程的興趣進行了探討。

一、現(xiàn)代教學方法的利與弊

隨著計算機科技的不斷進步,教學已經(jīng)從傳統(tǒng)的板書模式進入到現(xiàn)代多媒體教學模式中。多媒體技術(shù)應(yīng)用的初衷是提高學生的參與度,滿足教學手段更民主、多元化及個性化的教學目標,其優(yōu)點為表現(xiàn)力豐富,可以通過動畫、視頻、圖像、音頻等效果將抽象難懂的問題直觀化。其次,節(jié)省了大量的板書時間,同時教師可將教學的重點、難點鏈接,以益于學生直觀地了解并進行思維拓展(張林,2011)。多媒體最明顯的一個特點就是教學容量加大,但正是這些優(yōu)勢也伴隨相應(yīng)的問題:(1)重形式而忽視教學內(nèi)容。很多學校在進行教學管理及評價時,過分關(guān)注多媒體課件的形式以及學生的感受,導致有些教師過分注重多媒體的表現(xiàn)形式而忽視了教學的主要內(nèi)容。(2)教學容量和學生的吸收量之間反差較大。由于教學內(nèi)容和容量的增大,教師并沒有根據(jù)授課對象的具體情況合理安排和講授學科內(nèi)容,而被動的成了多媒體的播放員和解說員。總之,多媒體教學利大于弊,因而成為教學改革和發(fā)展的必然產(chǎn)物,雖有缺點,但不能因噎廢食,需通過其他方法來克服弊端才能達到完美的教學效果。

二、個性化習題是學生實踐提高的強力推動器

生物信息學是一門實踐性非常強的學科,為了加強學生的實踐能力,教師要綜合應(yīng)用啟發(fā)式、運用式及討論式等多種教學方法來激發(fā)學生的興趣。筆者在課堂實踐中,充分發(fā)揮個性化習題的作用,將教師的科研滲入到課堂,注重理論與實踐相結(jié)合,努力提高學生解決實際問題的綜合能力。比如,在講授第五章內(nèi)容電子克隆部分,此章節(jié)目的是通過一段表達序列標簽(EST),綜合應(yīng)用Blast、序列比對、步查法等方法查找各種數(shù)據(jù)庫,通過軟件的應(yīng)用進行拼接、預(yù)測、去除內(nèi)含子等方法,最終獲得可能的全長cDNA序列并加以注釋。在以往的教學練習中,全班同學的任務(wù)一樣,難以知道學生是否真正掌握所教授的內(nèi)容,為此,筆者將學生分組,每組自行通過閱讀文獻獲得一條其感興趣的EST序列,或者利用他們的畢業(yè)論文中涉及的EST序列去進行電子克隆練習,通過這種個性化習題的隨堂練習,能顯著強化學生的計算機應(yīng)用能力和實踐能力,同時也能提高學生在教學中的積極性、主動性和創(chuàng)新性。

三、發(fā)揮QQ群的投票功能在教學練習中的作用

生物信息學是一門交叉學科,對于非生物信息學專業(yè)的生命學院的學生而言,雖然教學大綱只要求學生掌握一些基本軟件的原理及數(shù)據(jù)庫的熟練使用。但是,這需要學生具有扎實的生物化學、遺傳學、細胞學及分子生物學的基礎(chǔ)知識。比如,在講授第三章“核酸序列的分析”時,會要求學生利用已知的EST序列去Blast查找與之有同源性的基因組序列,進行序列比對,預(yù)測并利用Bioedit軟件找出此基因的啟動子、終止子和剪接點。這首先要求學生必須明確這些分子生物學的概念,否則在有限的生物信息學課堂上,會變成分子生物學或遺傳學的復習課。而課外QQ群就起到了非常重要的交流促進作用。筆者在將QQ群的功能應(yīng)用到課外教學輔助平臺的基礎(chǔ)上,充分發(fā)掘QQ群的投票及評論功能為教學所用,例如教授第三章前,將課件放到QQ群的文件中,讓學生去預(yù)習。為激發(fā)學生預(yù)習的主動性,要求學生在評論中列出對本章的主要知識點或難點,并對課件中涉及的名詞進行解釋。為進一步加強理解,對投票功能進行設(shè)置,相應(yīng)的對投票選項1、2、3、4分別設(shè)置成A、B、C、D,這樣教師可根據(jù)需要將知識點轉(zhuǎn)化成練習題,以加強學生的學習。同時,也可鼓勵學生將一些新的感興趣的話題或問題置于QQ群??傊?,QQ群的投票功能可以成為教師與學生課下交流的一扇窗口,成為生物信息學的一種及時且重要的學習工具。

四、建議與展望

生物信息學是一門新興學科,但我國無論是在對學科的重視還是發(fā)展程度上,與國外都存在一定的差距。在美國,計算生物學國際協(xié)會教育委員會一直致力于將生物信息學整合到高中生物教材中,學生在高中即接觸生物信息學,而且高校對高中生物信息學的教學提供相應(yīng)的培訓課程和網(wǎng)上資源,生物信息學和其他分子生物學、植物學等一樣較早的深入到學生的知識體系中。而我國由于該學科產(chǎn)生的歷史較短,課程的開設(shè)集中在“985”、“211”重點院校的生物信息學專業(yè),盡管近十年來,各大高校也意識到此學科的重要性,且課程也在逐步在開設(shè),但由于學時短,很多教學僅限于學生掌握基本的數(shù)據(jù)庫的查詢。為使生物信息學能在普通院校的生命科學學院能很好的開展,各個高校應(yīng)建立合適的課程教學內(nèi)容。雖然近年“生物信息學”課程在各高校紛紛開設(shè),但由于生物信息學是一門發(fā)展中的學科,它的理論及內(nèi)容尚在不斷完善與更新中(郭麗等,2014)。因此,對于教材的選擇,不能只追逐信息量充足、內(nèi)容新穎、知識選材前瞻性好的教材(楊娥等,2014)。作為普通院校的非生物信息學專業(yè)的本科生,想在較短的時間內(nèi)(36課時)很好掌握如此大信息量的知識較為困難(劉宏生等,2010)。因此,需要依據(jù)學生基礎(chǔ)及院校的人才培養(yǎng)目標和現(xiàn)今生物信息學發(fā)展的現(xiàn)狀建立合理的課程內(nèi)容體系。另外,由于缺乏合適的專業(yè)人才,生物專業(yè)的生物信息學的師資力量薄弱,無法建成高水平的教學隊伍。因此,加大生物信息學教師的培養(yǎng)力度,建成一支專業(yè)的、年齡和知識結(jié)構(gòu)合理的師資隊伍,是提高本科院校生物信息學教學的關(guān)鍵問題之一。

參考文獻:

[1]Bloom,M. Biology in silico:The bioinformatics revolution[J]. The American Biology Teacher,2001,63(6):397-403.

[2]郭麗,趙楊,婁冬華,等.生物信息學實踐課教學改革探索[J].南京醫(yī)科大學學報(社會科學版),2014,(2):165-167.

[3]張林,柴惠.現(xiàn)代教學手段在生物信息學教學中的應(yīng)用[J].新課程研究,2011,(219):156-157.

第3篇:生物信息學培訓范文

1.1事實(Facts)

作為整個信息鏈的起點,事實就是事物在人類視野(感觀/邏輯)中的原始映像[1]。事實是事情的真實情況,包括事物、事件、事態(tài),即客觀存在的一切物體與現(xiàn)象、社會上發(fā)生的不平常事情和局勢及情況的變異態(tài)勢[2]。事實也是人類知識的起源,人類全部知識的最初信息基礎(chǔ)就是事實。

1.2數(shù)據(jù)(Data)

通常認為,數(shù)據(jù)是對事物純粹的、客觀的記錄,是原始的未經(jīng)解讀的數(shù)字、文字、圖像、符號、聲音、計算機代碼等[3]。而數(shù)據(jù)本身缺乏關(guān)聯(lián)和目的性,但當數(shù)據(jù)結(jié)合一定的背景、規(guī)則、意義之后,就會形成信息。

1.3信息(Information)

作為整個信息鏈中的中心鏈環(huán)的信息,它的下游是面向物理屬性的,上游是面向認知屬性的?!靶畔ⅰ奔扔形锢韺傩砸灿姓J知屬性,因此成為“信息鏈”的代表稱謂。

1.4知識(Knowledge)

知識來自于信息,信息只有同接收者的個人經(jīng)驗、信息與知識準備結(jié)合,也就是同接收者的個人背景融合才能轉(zhuǎn)化為知識,它比數(shù)據(jù)或信息更接近行動。知識必須經(jīng)過學習或研究以及從信息中經(jīng)過去粗取精、去偽存真等加工才能夠獲得[4]。

1.5情報(Intelligence)

情報是為實現(xiàn)主體某種特定目的,有意識地對有關(guān)的事實、數(shù)據(jù)、信息、知識等要素進行加工后得到的產(chǎn)物。情報既包含有信息的成分,也包含有知識的成分。從信息層面看,情報所包含的信息是與人類社會有關(guān)的;從知識層面看,情報是與知識的利用價值緊緊聯(lián)系在一起的。從一定程度上來說,情報是知識的子集。1.6智慧(Wisdom)智慧是能迅速、靈活、正確地理解和解決事物的能力。這種能力來源于人類基于已有的知識,是針對物質(zhì)世界運動過程中產(chǎn)生的問題,根據(jù)獲得的信息進行分析、對比、演繹,找出解決方案的能力。從嚴格意義上來講,智慧是屬于知識層面的,是人類大腦運用知識活動的產(chǎn)物———即運作和應(yīng)用知識的知識。有知識不一定有智慧,但有智慧一定有知識。知識只有轉(zhuǎn)化為智慧,才能顯示出其真正的價值。

1.7事實、數(shù)據(jù)、信息、知識、情報、智慧之間的關(guān)系

數(shù)據(jù)是客觀事實的記錄,信息是有意義的事實和數(shù)據(jù),知識是系統(tǒng)化的信息,情報是進入人類社會交流系統(tǒng)的運動著的知識,智慧是運用信息和知識解決問題的能力。這樣由事實(Facts)數(shù)據(jù)(Data)信息(In-formation)知識(Knowledge)情報(Intelligence)智慧(Wisdom)層層遞進,構(gòu)成了一條完整的信息鏈,見圖1[5]。

2醫(yī)學信息學的相關(guān)概念

2.1國外醫(yī)學信息學定義的三種導向

2.1.1以信息技術(shù)為導向定義側(cè)重于技術(shù)和工具,即通常強調(diào)以計算機為基礎(chǔ)的技術(shù)?!芭R床計算”、“醫(yī)學中的計算機”、“醫(yī)學計算機科學”、“計算機在醫(yī)學中的應(yīng)用”等認識比較常見[6]。

2.1.2以角色、任務(wù)或面向領(lǐng)域為導向定義側(cè)重于組織內(nèi)部信息人員的角色。例如,護理信息學、牙醫(yī)信息學等通過醫(yī)學信息學分支學科來定義。

2.1.3以概念為導向定義側(cè)重于如數(shù)據(jù)、信息和知識這些概念在醫(yī)學領(lǐng)域中的特定內(nèi)涵。從總體上來看,國外醫(yī)學信息學的定義是朝著形成基于數(shù)據(jù)、信息、知識的醫(yī)學信息學定義方向發(fā)展的。

2.2中國醫(yī)學信息學定義的兩種傾向

2.2.1基于字面拆分后的概念解析

第一種拆分是將“醫(yī)學信息學”拆分為“醫(yī)學”+“信息學”(medicalinformatics)———偏重于方法論層面。把“醫(yī)學信息學”定義為信息學在醫(yī)學領(lǐng)域中的應(yīng)用,同時確定醫(yī)學信息學的范圍是“醫(yī)學”和“信息學”之交叉。前者指其應(yīng)用領(lǐng)域,后者指其方法學。第二種拆分是將“醫(yī)學信息學”拆分為“醫(yī)學信息”+“學”(medicalinformationscience)———側(cè)重于學科體系層面(即理論與技術(shù)方法統(tǒng)一的學科體系)。把醫(yī)學信息學定義為研究“醫(yī)學信息”的一門科學,即研究醫(yī)學領(lǐng)域中的信息現(xiàn)象和信息規(guī)律的一門科學。

2.2.3基于國外醫(yī)學信息學定義的翻譯與重組

此類定義大多為將國外醫(yī)學信息學的定義翻譯成不同形式的漢語語言并且進行重組,與國外對醫(yī)學信息學的定義無太大區(qū)別。

3醫(yī)學信息學研究中的信息鏈

3.1“數(shù)據(jù)信息”鏈

這一環(huán)節(jié)的重點在于對醫(yī)療大數(shù)據(jù)的應(yīng)用。當下全球大量的公共衛(wèi)生信息、電子病歷信息、用藥信息、住院信息、圖像信息、管理信息、基因信息、醫(yī)學知識庫信息以及實驗室數(shù)據(jù)等構(gòu)成了醫(yī)療衛(wèi)生大數(shù)據(jù)[7]。隨著信息技術(shù)與衛(wèi)生及生物醫(yī)學日益緊密的結(jié)合,大數(shù)據(jù)對衛(wèi)生及生物醫(yī)學的研究與應(yīng)用也將產(chǎn)生深刻影響。因此,如何更好地利用大數(shù)據(jù)便成為信息技術(shù)與衛(wèi)生及生物醫(yī)學領(lǐng)域共同面對的挑戰(zhàn)。大數(shù)據(jù)在醫(yī)療行業(yè)可應(yīng)用于臨床、研發(fā)、公共衛(wèi)生和創(chuàng)新商業(yè)模式等領(lǐng)域,在健康領(lǐng)域的終極應(yīng)用是疾病診斷和預(yù)測性治療。雖然醫(yī)療大數(shù)據(jù)的研究和應(yīng)用如火如荼,但在應(yīng)用過程中也面臨著諸多問題,如數(shù)據(jù)的存儲、數(shù)據(jù)的整合、數(shù)據(jù)的挖掘利用和保護等方面都面臨著一些問題。這也就需要我們在利用醫(yī)療大數(shù)據(jù)的同時,變革數(shù)據(jù)管理方式、建立完善的區(qū)域衛(wèi)生信息化標準體系、積極探索利用數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)等等各種措施,利用創(chuàng)新的方法和模式,發(fā)揮大數(shù)據(jù)在醫(yī)院行政管理、健康教育與管理、衛(wèi)生信息服務(wù)和疾病的控制預(yù)防中的作用和價值。

3.2“信息知識”鏈

這一環(huán)節(jié)主要關(guān)注醫(yī)學知識庫的建立。數(shù)據(jù)庫是計算機應(yīng)用系統(tǒng)中的一種專門管理數(shù)據(jù)資源的系統(tǒng),它有文字、符號、圖形、圖像、數(shù)字及聲音等多種形式。而知識庫是知識工程中結(jié)構(gòu)化、易操作、易利用、有組織的知識集群,是針對某一(或某些)領(lǐng)域問題求解的需要,采用某種(或若干)知識表示方式在計算機存儲器中存儲、組織、管理和使用的互相聯(lián)系的知識集合區(qū)別與聯(lián)系[8]。知識庫的概念來自兩個不同的領(lǐng)域,一個是人工智能及其分支———知識工程領(lǐng)域,另一個是傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫領(lǐng)域。人工智能和數(shù)據(jù)庫兩項計算機技術(shù)的有機結(jié)合,促成了知識庫系統(tǒng)的產(chǎn)生和發(fā)展。建立醫(yī)學知識庫,需要一支多學科人才的專業(yè)隊伍,并且要能夠適應(yīng)數(shù)字化醫(yī)療向智慧化醫(yī)療的轉(zhuǎn)變需要,構(gòu)建大型的一站式通用智能醫(yī)學知識庫。建立知識庫,要以本體為建設(shè)思路和方法,不僅要構(gòu)建西醫(yī)學科的知識庫,更要構(gòu)建中醫(yī)學科知識庫,且重視與“大數(shù)據(jù)”醫(yī)療的整合,更好地利用臨床信息,將有用的信息知識化。

3.3“知識智慧”鏈

這一環(huán)節(jié)的著重點在于智慧醫(yī)療的實現(xiàn)。2008年,IBM首先提出了“智慧醫(yī)療”的概念。早期的智慧醫(yī)療強調(diào)物聯(lián)網(wǎng)的作用,設(shè)想把物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)充分應(yīng)用到醫(yī)療領(lǐng)域中,以實現(xiàn)醫(yī)療的信息互聯(lián)、共享協(xié)作、臨床創(chuàng)新、科學診斷以及公共衛(wèi)生預(yù)防。而未來的智慧醫(yī)療將是以衛(wèi)生信息化和信息共享為基礎(chǔ),以患者為中心,以個性化、智能化醫(yī)療服務(wù)為核心的醫(yī)療服務(wù)體系[9]。智慧醫(yī)療包括了智慧醫(yī)院、區(qū)域醫(yī)療、家庭自助健康監(jiān)護等多種服務(wù)方式,它將成為未來醫(yī)療衛(wèi)生信息化發(fā)展的主要潮流。智慧醫(yī)療可以創(chuàng)建一個更加合理的醫(yī)療產(chǎn)業(yè)鏈,并且使用戶體會到更加智能化和協(xié)調(diào)化的醫(yī)療服務(wù)[10]。

4醫(yī)學信息學的未來發(fā)展方向

4.1學科體系的協(xié)同融合,加速了生物醫(yī)學信息學的形成與發(fā)展

醫(yī)學信息學(MedicalInformatics,MI)和生物信息學(Bioinformatics,BI)雖然產(chǎn)生背景不同,但是進入后基因組時代之后,生物信息學和醫(yī)學信息學的邊界趨于模糊,互相滲透和結(jié)合的趨勢明顯。其目的就是要提供新的生物醫(yī)學知識的開發(fā)和共享框架。正是兩者的協(xié)同融合加速產(chǎn)生了一門新的學科———生物醫(yī)學信息學(BiomedicalInformatics,BMI)??梢灶A(yù)見的是,基于相同的學科理論基礎(chǔ)和彼此交叉融合的研究內(nèi)容,生物醫(yī)學信息學一定是醫(yī)學信息學和生物信息學未來的發(fā)展方向。

4.2學科研究向促進“轉(zhuǎn)化研究”的方向發(fā)展

首先,在信息鏈的研究視角下,醫(yī)學信息學的發(fā)展會更加注重信息鏈中的要素從低層次到高層次的鏈環(huán)轉(zhuǎn)化;其次,在醫(yī)療領(lǐng)域,醫(yī)學信息學面臨的最大的挑戰(zhàn)是如何將生物醫(yī)學研究領(lǐng)域的成果快速、可靠地轉(zhuǎn)化為現(xiàn)實可用的臨床解決方案。同時,醫(yī)學信息學出現(xiàn)了新的分支學科,即轉(zhuǎn)化醫(yī)學信息學。轉(zhuǎn)化醫(yī)學信息學通常被認為是以轉(zhuǎn)化醫(yī)學中的相關(guān)信息問題為研究對象,結(jié)合信息科學、理論基礎(chǔ)和應(yīng)用技術(shù),服務(wù)于轉(zhuǎn)化醫(yī)學的研究,其目的是促進基礎(chǔ)醫(yī)學研究成果順利向臨床應(yīng)用轉(zhuǎn)化[11]。轉(zhuǎn)化醫(yī)學信息學的研究內(nèi)容包括醫(yī)學信息的標準化和醫(yī)學數(shù)據(jù)的組織與存儲等。它可以利用信息技術(shù)有效地加快基礎(chǔ)研究變?yōu)榕R床應(yīng)用,有力地促進轉(zhuǎn)化醫(yī)學的發(fā)展。

4.3學科的社會服務(wù)功能不斷提升

4.3.1個性化

個性化意味著衛(wèi)生信息管理和衛(wèi)生信息服務(wù)以用戶為中心,圍繞每個用戶的狀態(tài)、需求乃至興趣愛好來采集信息或提供信息服務(wù)。可以設(shè)想,在未來每個患者都將擁有自己的個人健康中心。

4.3.2智能化

智能化意味著通過對既有信息的分析,挖掘其中的規(guī)律,利用獲得的規(guī)律來處理新的信息,并給用戶提供科學合理的建議。

4.4新技術(shù)支撐和引領(lǐng)著醫(yī)學信息學的未來發(fā)展

在未來發(fā)展中,許多嶄新的技術(shù)可以有效地促進醫(yī)學信息學的研究和應(yīng)用的發(fā)展。遠程醫(yī)療(Telemedicine):計算機技術(shù)、多媒體技術(shù)、通信技術(shù)與醫(yī)療技術(shù)結(jié)合。移動醫(yī)療(MobileHealth):通過移動通信技術(shù)來提供醫(yī)療服務(wù)。健康物聯(lián)網(wǎng)(TheInternetofthings):利用物聯(lián)網(wǎng)進行健康和疾病的管理。健康云(Healthcloud):以SaaS的方式向醫(yī)院和醫(yī)療機構(gòu)提供醫(yī)院管理和居民健康檔案管理方面的服務(wù)。醫(yī)療大數(shù)據(jù)(Medicalbigdata):大數(shù)據(jù)技術(shù)與醫(yī)療行業(yè)結(jié)合,充分開發(fā)利用醫(yī)療數(shù)據(jù)蘊含的信息與價值。轉(zhuǎn)化醫(yī)學(TranslationalMedicine):建立基礎(chǔ)研究與臨床醫(yī)療間更為直接便捷的聯(lián)系。智慧醫(yī)療(Wisemedical):使用物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)打造健康檔案和醫(yī)療信息平臺,實現(xiàn)患者與醫(yī)護人員、醫(yī)療機構(gòu)和醫(yī)療設(shè)備的互動。

4.5我國醫(yī)學信息學學科發(fā)展亟待解決的問題

我國醫(yī)學信息學最近幾年發(fā)展很快,但學科研究體系不夠完善和成熟、學科建設(shè)和理論研究比較薄弱、標準設(shè)置滯后、系統(tǒng)規(guī)劃和人才不足等問題制約了醫(yī)學信息學的健康發(fā)展。

4.5.1亟需解決學科正名和專業(yè)名稱規(guī)范化問題

醫(yī)學信息學在國內(nèi)的學科地位的確很尷尬,主要表現(xiàn)在國內(nèi)的三大學科體系(目錄),即“中國圖書館分類法”(簡稱中圖法)、“國家標準的學科分類與代碼”(簡稱國標法)、“教育部頒布的學科專業(yè)目錄”(簡稱教育法)中均沒有“醫(yī)學信息學”的類名。因此,當務(wù)之急是要盡快確立“醫(yī)學信息學”的學科名稱及其在學科體系中的位置。醫(yī)學信息教育在國內(nèi)看似很火爆,其實是亂象叢生。此前教育部只批了中南大學、南通大學、徐州醫(yī)學院的醫(yī)學信息學專業(yè),但國內(nèi)很多學校都在信息管理與信息系統(tǒng)等專業(yè)后面加括號注明“醫(yī)學信息學方向”,然后對外宣稱是醫(yī)學信息學專業(yè)。與此類似的還有一種叫“衛(wèi)生信息管理專業(yè)”。顯然這都是不負責任的做法。因此,希望教育主管部門加大宏觀指導與調(diào)控力度,規(guī)范醫(yī)學信息學的學科建設(shè)與專業(yè)教育。首先,在學科及專業(yè)目錄上設(shè)立獨立的“醫(yī)學信息學”,既不要讓“醫(yī)學信息學”依托(附)于其他學科/專業(yè),也不需要在別的學科/專業(yè)后面的括號內(nèi)出現(xiàn)“醫(yī)學信息學”。根據(jù)教育部2012年9月頒布的《普通高等學校本科專業(yè)目錄》,建議將“醫(yī)學信息學”納入到“特設(shè)專業(yè)”中的“1010醫(yī)學技術(shù)類”。其次,成立全國醫(yī)學信息學教學指導委員會(教指委),規(guī)范指導醫(yī)學信息學的專業(yè)教育。再次,協(xié)調(diào)指導“醫(yī)學信息”類的學術(shù)組織,整合醫(yī)學信息學的學術(shù)研究力量和研究隊伍,指引醫(yī)學信息學的健康發(fā)展。

4.5.2加強學科課程的設(shè)置和培養(yǎng)目標的確立

我國醫(yī)學信息學專業(yè)的本科課程設(shè)置比較落后,學科的課程體系不完善且專業(yè)教材缺乏,不同學校的教學內(nèi)容和培養(yǎng)目標差別很大,體現(xiàn)不出學科的重要性和交叉復雜性。故要求科學合理地加強學科的課程設(shè)置,正確處理好計算機科學、醫(yī)學和信息科學之間的關(guān)系,參照國外已有的教學方案并聯(lián)系自己的教學實際情況去充實教學計劃,擴寬教學范疇,使整個醫(yī)學信息學的教育更加合理。4.5.3實現(xiàn)專業(yè)教育體系化,加強專業(yè)人才的培養(yǎng)由于沒有認識到醫(yī)學信息學教育的重要意義,醫(yī)學信息學地位不高,所以學科的科研投入、教育投入和人才培養(yǎng)都面臨難題,教材和師資的缺乏也導致了專業(yè)教育規(guī)范化和體系化不足。為此,要深刻認識到醫(yī)學信息學教育的意義,推動專業(yè)教育向規(guī)范化和體系化邁進。醫(yī)學信息學作為一門新興學科,其發(fā)展需要大批的高水平人才。人才的培養(yǎng)需要在專業(yè)教育中實現(xiàn),只有通過規(guī)范科學的教育體系培養(yǎng)高素質(zhì)的醫(yī)學信息學人才,培養(yǎng)醫(yī)學信息學研究的復合型人才和對在崗人員進行進修培訓,才能適應(yīng)醫(yī)學信息學的快速發(fā)展。

5結(jié)語

第4篇:生物信息學培訓范文

速度就是效果

截止2012年,華大基因共擁有4大平臺,包括新一代測序平臺、云計算平臺、蛋白質(zhì)譜平臺及國家基因庫。在新一代測序平臺中包括羅氏旗下的454生命科學推出最新升級版Roche 454 GS FLX+測序儀、Illumina公司推出的HiSeq 2000測序儀、基于半導體芯片的新一代測序技術(shù)Ion Torrent等多種不同的測序技術(shù)平臺。以Illumina Hiseq 2000測序儀為例,相對于傳統(tǒng)測序的96道毛細管測序,高通量測序一次實驗可以讀取40萬到400萬條序列。讀取長度根據(jù)平臺不同從25bp到450bp不等,不同的測序平臺在一次實驗中,可以讀取1G到14G不等的堿基數(shù),這樣龐大的測序能力是傳統(tǒng)測序儀所不能比擬的。華大深圳數(shù)據(jù)中心138臺高通量測序儀單次運行就能產(chǎn)生350GB數(shù)據(jù),一天的數(shù)據(jù)產(chǎn)出量大概是10TB。為應(yīng)對巨大的數(shù)據(jù)產(chǎn)出量,從2009年開始華大基因?qū)MC Isilon橫向擴展存儲系統(tǒng)分別進行了功能測試和性能測試。如今,已經(jīng)部署了超過7.4PB(7400TB)的Isilon設(shè)備,包括:17個節(jié)點IQ 36000x集群一套、10個節(jié)點IQ 72000x集群一套、13個點節(jié)IQ 36000x集群一套、10個節(jié)點IQ36000x集群一套。

華大基因研究院生物信息學研究主管表示,“我們每天有數(shù)千個應(yīng)用程序在訪問EMC Isilon存儲,其在高并發(fā)訪問條件下的性能令人印象深刻。”生命科學和基因研究都要產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),并且這些數(shù)據(jù)還需要永 遠的保存起來。而從技術(shù)上來說,Isilon橫向擴展NAS存儲解決方案提供高效的單個文件系統(tǒng)/單個卷,可擴展至20PB。通過將存儲整合成一個單一,可擴展卷,讓任何人都可以來管理,Isilon存儲增加了數(shù)據(jù)管理的簡易性,減少了人員培訓的時間,簡化了大數(shù)據(jù)生命周期管理。對于像華大基因這樣的研究機構(gòu),數(shù)據(jù)是核心資產(chǎn)。如何保證輸入(原始)數(shù)據(jù)的萬無一失,如何確保存儲系統(tǒng)可靠穩(wěn)定,以及如何保證數(shù)據(jù)生命周期內(nèi)的安全,是很多高性能用戶最為關(guān)注的。Isilon N+M架構(gòu)讓用戶根據(jù)應(yīng)用和數(shù)據(jù)生命周期價值的不同,選擇存儲安全配置策略,靈活滿足不同業(yè)務(wù)、不同應(yīng)用和不同數(shù)據(jù)對安全性的要求。Isilon的FlexProtect技術(shù)保證了數(shù)據(jù)的高可用和業(yè)務(wù)連續(xù)性。

2012年4月,華大基因又推出了基于Hadoop架構(gòu)的云計算平臺,并在11月最新版的生物信息學軟件,包括最新版SOAP系列軟件、遺傳變異檢測軟件、宏基因組測序數(shù)據(jù)分析軟件Metacluster 4.0及兩個基于云計算的軟件Hecate2和Gaea2。這也是華大基因選擇和持續(xù)采用Isilon集群存儲的重要考慮之一。Isilon和Hadoop做了緊密技術(shù)整合,使存儲能很好地支持Hadoop架構(gòu)的云計算服務(wù)。如果使用傳統(tǒng)存儲,Hadoop仍有一些固有問題需要解決。例如,ApacheTMHadoopTM的NameNode存在單點故障問題。NameNode用于管理HDFS中存儲的元數(shù)據(jù)文件,它是HDFS文件系統(tǒng)的核心部分,存放著文件系統(tǒng)中所有文件的目錄樹。客戶端應(yīng)用程序通過NameNode來定位、添加、修改、拷貝、移動和刪除文件。如果NameNode發(fā)生故障,文件系統(tǒng)就會離線。

精益求精

目前,華大基因每年的業(yè)務(wù)量成倍增長:2010年4PB,2011年8PB,2012年10PB。華大基因計算中心主管介紹,這些針對數(shù)據(jù)的典型應(yīng)用包含了結(jié)構(gòu)化和非結(jié)構(gòu)化的計算模式,同時對一個任務(wù)的數(shù)據(jù)量的規(guī)模非常大,對計算內(nèi)存和存儲帶寬的需求也非常高。目前華大基因一天在計算集群上數(shù)據(jù)的吞吐量大概為320T,這相當于Google的十分之一。華大基因現(xiàn)在有接近2000個計算節(jié)點,總的計算核心大概2萬個。處理如此規(guī)模的數(shù)據(jù)量,對IT提出了巨大的挑戰(zhàn)。而Isilon在性能、擴展性、簡單易用、數(shù)據(jù)安全性方面的表現(xiàn)讓華大找到了精益求精的出路。

在性能方面,將500TB容量、13個節(jié)點分為一組,可以達到2GB/秒的存取速度。在擴展性方面,Isilon設(shè)備的安裝部署十分快捷簡單,每套系統(tǒng)只需要大約半天時間即可上線提供使用。容量擴展的同時,整個計算平臺的性能也得以提升。華大基因計算中心系統(tǒng)管理人員說:“Isilon系統(tǒng)非??煽?,安裝部署十分方便,運維工作也很簡單輕松?!逼渲?,華大基因最初購買的10個節(jié)點集群擴容成17個節(jié)點,就是由華大基因自己完成的。

在簡單易用方面,除了安裝部署簡便以外,運維管理也非常簡單。華大基因7.4PB的設(shè)備,只需要3名工程師就能管理。平時只要看看控制面板有沒有告警之類的信息就可以了。如果有告警,系統(tǒng)同時也會發(fā)郵件通知管理員。Isilon一個文件系統(tǒng)可以支持15PB容量,華大基因所有存儲容量都可以放在一個文件系統(tǒng)中,由系統(tǒng)自動按需分配使用。

第5篇:生物信息學培訓范文

以轉(zhuǎn)化理念指導醫(yī)學院校的人才培養(yǎng)

由于臨床工作與基礎(chǔ)研究的脫節(jié),醫(yī)師與基礎(chǔ)研究之間缺少溝通交流,許多臨床有價值的發(fā)現(xiàn)亦無法準確反饋給基礎(chǔ)研究者。那么,在我國準備進一步擴大轉(zhuǎn)化醫(yī)學的研究規(guī)模、進一步深化轉(zhuǎn)化醫(yī)學的研究內(nèi)涵的今天,作為醫(yī)學院校及醫(yī)院科研工作的管理人員應(yīng)該如何以轉(zhuǎn)化醫(yī)學理念指引科研方向呢?著眼于重大疾病并以此作為科研出發(fā)點醫(yī)學科學研究服務(wù)于人。只有當提出的科研問題來自于臨床實踐,以解決重大疾病為出發(fā)點,才能體現(xiàn)其真正的價值。轉(zhuǎn)化醫(yī)學旨在促進基礎(chǔ)醫(yī)學研究成果快速轉(zhuǎn)化到臨床應(yīng)用,如果將研究的對象鎖定在患者身上,注重疾病的早期檢查和早期評估,并據(jù)此進行科研選題和研究,當獲得成果時可同時開展轉(zhuǎn)化研究,使研究成果迅速用于臨床,再根據(jù)臨床效果發(fā)展為深層次的研究,如此反復,形成良性循環(huán),最終造福于人類健康。進行轉(zhuǎn)化性醫(yī)學研究的目的是培養(yǎng)既會研究又能看病、有轉(zhuǎn)化醫(yī)學理念和能力、基礎(chǔ)與臨床結(jié)合的高水平人才。目前,轉(zhuǎn)化醫(yī)學的主要研究領(lǐng)域:①腫瘤:通過基因組、蛋白質(zhì)組學分析,找出腫瘤發(fā)生的標記物;利用癌細胞代謝產(chǎn)物圖譜和定量分析系統(tǒng),檢測處于早期階段的癌細胞;應(yīng)用分子生物學手段,研究細胞信號傳導通路在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用;應(yīng)用藥理學分析手段,評價藥物在治療腫瘤中的效果等。②傳染?。喊ò滩 ⒏窝?、流感、瘧疾等的發(fā)病機制;抗病毒的藥物和抑制劑;疫苗的研發(fā)以及免疫佐劑的效果等。③心腦血管疾病:找出與疾病發(fā)病相關(guān)的高風險因素,做到早期預(yù)防;分析在疾病發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用的蛋白分子,制備蛋白抑制劑或單克隆抗體;尋求改善循環(huán)功能的藥物,根據(jù)患者發(fā)病機制不同,設(shè)立個性化治療方案,伍用藥物的同時注意藥代動力學的改變并降低藥物的毒副作用等。④神經(jīng)系統(tǒng)疾?。横槍Π柎暮D喜〉陌l(fā)病機制與聯(lián)合治療方案的研究;改善帕金森癥狀的新藥物的研發(fā);基因治療與干細胞治療等。⑤其它:除上述領(lǐng)域外,轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究還涉及代謝疾病、運動系統(tǒng)疾病、遺傳病和器官移植等方面。雖然我國的轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究才剛剛起步,較大規(guī)模的專門的轉(zhuǎn)化醫(yī)學中心還比較少,但很多大學、醫(yī)院科研機構(gòu)和生物醫(yī)藥公司之間開展的合作,都可以歸為轉(zhuǎn)化醫(yī)學,專門的轉(zhuǎn)化醫(yī)學中心也已經(jīng)開始建立。上海交通大學與阿斯利康合作,建立新藥物研發(fā)基地;北京協(xié)和醫(yī)院成立轉(zhuǎn)化醫(yī)學中心;中國醫(yī)科大學成功引進高水平人才,組建轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究所,以“教育部醫(yī)學細胞生物學重點實驗室”為依托,橫向整合“遼寧省實驗動物轉(zhuǎn)基因重點實驗室”以及“臨床老年病研究室”,并與“遼寧省內(nèi)分泌疾病重點實驗室”合作,圍繞細胞衰老及與衰老相關(guān)疾?。ㄉ窠?jīng)退行性變、腫瘤、心血管疾病、糖尿病等)一系列課題展開研究工作。以轉(zhuǎn)化醫(yī)學思維指導醫(yī)學人才的培養(yǎng)轉(zhuǎn)化醫(yī)學是溝通臨床和基礎(chǔ)的橋梁,因此從事該研究的專業(yè)人員需同時具有相當?shù)呐R床及基礎(chǔ)科研背景,即基礎(chǔ)-臨床復合型人才。臨床醫(yī)師每日需要進行繁忙的工作,會有較多問題需要解決。要在進行臨床工作的同時從事相關(guān)的基礎(chǔ)研究是很不現(xiàn)實的。而相關(guān)醫(yī)學基礎(chǔ)研究人員多為生物學背景,擁有熟練的實驗操作技能和扎實的理論基礎(chǔ),但其一般沒有參加臨床工作的經(jīng)歷,無法從事醫(yī)療服務(wù),很難把握臨床需求。因此,重視和加緊培養(yǎng)兼?zhèn)涠喾矫嬷R技能的復合型人才尤為重要。在本科教育階段,引導學生逐漸認識到基礎(chǔ)學科與臨床學科互為依存的關(guān)系,既要強化其基本實驗技能的培訓,又要重視其臨床經(jīng)驗的積累。研究生教育是我國培養(yǎng)高等醫(yī)學人才的最高階段,也是培養(yǎng)轉(zhuǎn)化醫(yī)學人才的最重要平臺。對碩、博士研究生輸入并幫助其建立轉(zhuǎn)化醫(yī)學理念,指導其從臨床實踐中選題并進行研究,從一開始就樹立正確的、基于臨床的科研方向。在繼續(xù)教育課程中,安排一定比例的轉(zhuǎn)化醫(yī)學課程(如轉(zhuǎn)化醫(yī)學概念、歷史背景、當今發(fā)展、未來作用、臨床研究路徑變遷,基礎(chǔ)研究課程),訓練臨床醫(yī)師縝密的科研思維、使他們了解基本的實驗技巧和方法、認識循證醫(yī)學的設(shè)計理念等,對于提高臨床醫(yī)師對自己從事的臨床工作認識,重視其所掌握的臨床資源,使醫(yī)師的認識從原來較低的疾病診治層面上升到學科發(fā)展的層次,從而逐步培養(yǎng)我們國家自己的轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究人才并形成人才梯隊。中國醫(yī)科大學自2004年啟動美國中華醫(yī)學基金會項目,并舉辦全校性PBL教學培訓,突破傳統(tǒng)灌輸式教學模式,以病例為中心,整合生理學、病理學、病理生理學和藥理學等領(lǐng)域,以培養(yǎng)學生的綜合思維能力和學習技巧,摒除了以往將醫(yī)學基礎(chǔ)知識切割、學生學完不知所用的弊端[7];在醫(yī)學本科教育結(jié)束之前,除了著重加強學生對臨床知識和技能的掌握之外,還鼓勵學生“回歸基礎(chǔ)”,可以根據(jù)自己的興趣結(jié)合在臨床實習的見聞,選擇進入相應(yīng)的基礎(chǔ)學科展開科學實驗,以臨床需要指導基礎(chǔ)研究;對于七年制和八年制學生的培養(yǎng),學校更是要求學生深入基礎(chǔ)研究,培養(yǎng)全面設(shè)計實驗研究的思維,掌握分子生物學實驗技術(shù)和數(shù)據(jù)分析方法,從而提高在臨床工作中分析問題、解決問題的能力。

合理構(gòu)建轉(zhuǎn)化醫(yī)學管理模式

如何依據(jù)我國國情、有效利用已有資源,合理組建轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究機構(gòu),實現(xiàn)各研究平臺的整合與人性化管理,目前仍處于探索階段。轉(zhuǎn)化醫(yī)學的實踐活動需要掌握多方面的能力,對組織與管理水平都有深度和廣度的要求。首先,學校的教務(wù)部門與醫(yī)院的科教部門在轉(zhuǎn)化醫(yī)學雙向研究合作的過程中,利用掌握的臨床學科資源,引導臨床科學家和學院研究人員進行各種形式的交流,鼓勵員工提出臨床面臨的難題和解決后效益,促使基礎(chǔ)研究者有的放矢,將加速轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究。其次,要注重整合資源,建立共享平臺,建立整合患者的危險因素、臨床診治、生存和預(yù)后等臨床組學(clinomics)數(shù)據(jù)庫資料,以及具有完整的患者生物標本的、開放式的疾病轉(zhuǎn)化研究平臺,把實驗室和運用生物信息學技術(shù)發(fā)現(xiàn)的生物標志物進行快速鑒定和評估,以真正實現(xiàn)轉(zhuǎn)化醫(yī)學的目的。惡性腫瘤等重大復雜疾病的防治研究,需要整合生物技術(shù)、計算數(shù)學、生物信息學、計算機科學和I臨床醫(yī)學等多學科研究人員的交叉研究,才能揭示環(huán)境、生活方式、遺傳等因素對癌癥發(fā)生的相互作用。最后是政策引導,國家各種研究基金和藥物開發(fā)項目的實施原則要有利于貫徹轉(zhuǎn)化醫(yī)學的理念,鼓勵發(fā)展交叉學科,注重成果轉(zhuǎn)化,這將有助于在實際工作中形成臨床與基礎(chǔ)研究一體化的研究團隊和學術(shù)思想。4結(jié)語轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究是新世紀醫(yī)學發(fā)展的新方向,轉(zhuǎn)化醫(yī)學的發(fā)展將推動醫(yī)學應(yīng)用科學的發(fā)展,是醫(yī)學科研的希望與未來。作為一個多學科交叉的領(lǐng)域,要發(fā)展、成熟,并推動其它領(lǐng)域的進步,要經(jīng)過很長的積累和不斷的革新,需要整合多學科知識、彼此相互交流和完善,才能最大限度的發(fā)揮轉(zhuǎn)化醫(yī)學的作用。我國已經(jīng)具備了開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究的基本條件,并取得了初步成績,結(jié)合我國病例資源豐富的優(yōu)勢大力發(fā)展轉(zhuǎn)化醫(yī)學,將促進我國生物醫(yī)藥研發(fā)、在重大疾病發(fā)病機制研究上取得突破性進展。我國高等醫(yī)學院校應(yīng)抓住機遇,以轉(zhuǎn)化醫(yī)學理念為指導,培養(yǎng)高水平綜合素質(zhì)人才,制定轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究計劃,為基礎(chǔ)和臨床研究構(gòu)建廣闊、完善的交流平臺,最終提高我國的醫(yī)學科學水平,為全人類的生命健康做出貢獻。

作者:宋曉宇 徐紅德 馮艷玲 曹流 單位:中國醫(yī)科大學轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究所

第6篇:生物信息學培訓范文

移動學習的力量移動學習的出現(xiàn)讓傳統(tǒng)教學出現(xiàn)了革命性的變化。在傳統(tǒng)的信息化課堂教學中,教師利用PPT或視頻傳遞相關(guān)信息和知識點,學生接受信息、知識點并完成作業(yè),最后通過考試對學生進行評估。在學習過程中,教師作為主體負責提供內(nèi)容、反饋并評估學生。傳統(tǒng)的課堂教學對學生所造成的壓力較大,也沒有除了考試外的有效評估手段,教師很難得知學生到底有沒有理解獲取的信息。另外,傳統(tǒng)的課堂教學將教師置于長時間的工作環(huán)境中——他們負責收集、提供、反饋和評估,尤其是在班級人數(shù)超過40人的情況下,教師的工作負荷讓他們無法進行自身職業(yè)發(fā)展,導致未來的諸多教學問題。

移動學習的出現(xiàn)在某種意義上改變了這一狀況。首先,移動學習通過科技的輔助,提供了一整套管理和評估方法,將教師從大量的重復勞動中解放出來。例如,在一次考試后,教師批改試卷時需要收集錯題信息并分析信息,這個過程煩瑣且冗長,有了科技的輔助,教師只需要點幾個按鈕即可了解學生的基本情況??荚嚨腻e題信息會通過直觀的統(tǒng)計圖的方式展現(xiàn)給教師,也便于橫向和縱向?qū)Ρ取?/p>

其次,教師傳遞的信息并不一定能被學生完全理解,移動學習允許學生使用完全理解的信息幫助學習。Stephen Krashen提出了輸入假設(shè)(comprehensibleinput),認為學生只有在接受可理解的信息時,才能最終獲得知識。但Susan Gass和Michael Long等研究者認為可理解信息只是單方面的。由于每位學生的智商、理解能力、背景知識等個人狀況都不相同,教師提供的可理解信息并不確定能夠被所有的學生理解。于是Susan Gass和Michael Long就提出了被理解的信息輸入(comprehended input),即輸入信息只有被接收者真正理解時才有價值。這就像生物信息學家向地質(zhì)學家講述蛋白質(zhì)的折疊、誤折和聚合一樣,即便生物信息學家使用了淺顯易懂的語言(他們認為自己傳達出了可理解的信息),由于缺乏相關(guān)背景知識,地質(zhì)學家依舊無法真正理解蛋白質(zhì)的折疊問題(信息并沒有被理解)。在移動學習中,學生通過自己的理解能力和相關(guān)的背景知識自己決定是否對相關(guān)信息進行深挖或補充,或是尋找更容易理解的信息幫助自己理解——通過視頻、動畫、互動等方式實現(xiàn)。

再次,移動學習能讓學生更好地參與和控制學習過程,也讓教師更好地了解學生的學習過程。個性化學習環(huán)境強調(diào)了學生對于學習過程的掌控和調(diào)整,而移動學習恰恰是建立個性化學習環(huán)境的方式之一。在傳統(tǒng)的課堂學習里,學生跟著教師的節(jié)奏進行學習,無論理解能力好壞,都必須接受完全一樣的信息。另外,有些學生習慣于寫,有些學生習慣于讀,還有些學生習慣于聽,不同的學習風格無法最大化課堂教學效果。但在移動學習中,學生可以按照自己的學習習慣和自己集中注意力的能力對學習過程進行掌控,以達到最好的學習效果。與此同時,教師的教學也可以更有針對性。教師可以通過移動設(shè)備觀察合作、參與環(huán)節(jié),并通過設(shè)備收集的數(shù)據(jù)了解學生的優(yōu)勢和劣勢,對此做出有針對性的幫助即可滿足學生需求。當每位學生都使用移動設(shè)備時,完成整體任務(wù)的比例可以觀察,這相較于傳統(tǒng)課堂是一個極大的進步。傳統(tǒng)課堂的小組討論和小組合作中,如果有學生不參與討論或合作,在最終的結(jié)果中很難體現(xiàn),但有了科技的幫助,教師有能力了解每一位學生對某一任務(wù)的貢獻和完成度,了解學生的學習狀態(tài)并做出即時反饋。當然,評估標準的設(shè)定也不再是全國或全省一個標準。由于教師有能力收集到充足的數(shù)據(jù),他們可以根據(jù)學生的水平設(shè)計完全符合他們成長規(guī)律的標準,并幫助學生最終達到這些標準。

最后,移動學習提供了溝通和交流的環(huán)境,幫助學生真正地理解知識,完成創(chuàng)造過程。學生通常在討論中才能夠理解、應(yīng)用所學到的知識,而這卻是傳統(tǒng)課堂不具備的。在移動學習中,學生可以利用設(shè)備的種種特性,創(chuàng)造屬于他們自己的內(nèi)容,分享內(nèi)容給伙伴,分享達到學習目標的不同途徑。

教師也不需要在45分鐘內(nèi)不斷講述各種知識點。相反,教師只需要在課程開始時將含有知識點的資源交由學生自己定位、搜尋、過濾和評估相關(guān)信息,再由教師引導學生完成對信息的討論、總結(jié)、反思和創(chuàng)造等過程。在課堂外,教師則可以根據(jù)學生情況提供各種資源鏈接,即可引導出類似課堂中的學習過程。

移動學習的出現(xiàn),對教師教學的方式方法有著極大的影響,更完全變革了學生學習的方法。教師不再只是信息傳遞者,還需要兼?zhèn)錁O強的信息創(chuàng)造、收集、分析、評估和引導能力。學生也不再只是信息接收者,還需要兼?zhèn)錁O強的思維、辯證、判斷、定位、過濾、互動、溝通等能力。移動學習也不再是傳統(tǒng)教育所代表的行為和認知過程,更是一種創(chuàng)造、批判、交流和互動的過程。圖1~3分別為傳統(tǒng)學習、信息化學習和移動學習的特點。總的來說,移動學習改變了過去傳統(tǒng)的學習,包括了書本、考試和教師等因素,并創(chuàng)造了包含信息資源、形成性和總結(jié)性評估以及輔導員的全新學習模式。移動學習將書本變成了多媒體的信息資源,考試變成了形成性的評估,以了解學生的實時狀態(tài),并結(jié)合總結(jié)性評估重新對學生的表現(xiàn)進行統(tǒng)計。

移動學習在國內(nèi)的發(fā)展瓶頸

1. 移動學習≠ 移動化學習

TechEDGE中國子項目在2013年10月針對國內(nèi)的中小學教師做了一次調(diào)查,研究他們使用教育科技進行教學的態(tài)度和方法。在調(diào)查中,我們涉及移動教學相關(guān)的部分。調(diào)查結(jié)果顯示,超過90%的教師都在日常生活中使用手機、平板電腦或電子閱讀設(shè)備,大約23%的教師在課堂中使用了移動設(shè)備進行教育,使用的主要設(shè)備為平板電腦。100%使用平板電腦的教師把平板電腦當作一種信息展示設(shè)備使用,即多媒體播放設(shè)備。他們要求學生使用平板電腦觀看與課程相關(guān)的PPT或視頻,把移動設(shè)備當作一種教學設(shè)備而不是學習設(shè)備。對照Laurillard的對話框架,學生使用移動設(shè)備的學習過程沒有對應(yīng)四個過程中的任何一個,而變成了和黑板一樣的信息傳遞平臺。同時,過度依賴第三方的課件內(nèi)容強制學生根據(jù)教師的節(jié)奏和內(nèi)容進行學習,忽略了互聯(lián)網(wǎng)和軟件應(yīng)用在學習中的作用。在移動科技環(huán)境的公式中,一旦移動軟件應(yīng)用s(MA)和互聯(lián)網(wǎng)i的作用消失,移動科技環(huán)境A就變成了僅包括設(shè)備d和移動能力m,限制了學習的發(fā)生。因為缺少的移動應(yīng)用和互聯(lián)網(wǎng)功能所帶給學生的互動、討論和反饋環(huán)節(jié),移動學習的優(yōu)勢變成了單純的移動化學習,在特性上很難和傳統(tǒng)學習方式區(qū)分。

2. 教師職業(yè)發(fā)展

教師在學生的學習過程中扮演著極其重要的角色,移動學習中也不例外。移動科技在學習中的應(yīng)用減少了對教師教學行為的依賴,卻對教師的整體設(shè)計和掌控能力提出了更高的要求。首先,教師需要學習如何將21世紀能力和課程進行整合。這是一項龐大的工程,不僅需要教師了解整合、傳遞和評估的過程,更需要教師提高課堂的自由度,允許學生發(fā)散思維、使用移動設(shè)備整合信息。其次,國內(nèi)對教師的職業(yè)發(fā)展關(guān)注度很高,投入了大量的人力、物力、財力幫助教師適應(yīng)新時代的教學,但國內(nèi)的教師職業(yè)能力培養(yǎng)卻很容易成為“ 一錘子買賣”,即對某一部分的知識只進行若干次的培訓, 完成培訓后缺乏跟進。這就像在學校四周建立四面墻, 將學校孤立在新的信息時代。TechEDGE項目總負責人Guy Trainin指出,教師常常被強制進行各種培訓,而他們通常對培訓內(nèi)容并沒有多大的興趣,這也是導致跟進的培訓無法進行或根本沒有跟進相關(guān)培訓的原因之一。如何利用移動設(shè)備幫助學生進行學習是一個長期的過程,科技和設(shè)備的特性在發(fā)展,在教學和學習中的方法也不同。軟件開發(fā)者也在不斷地開發(fā)功能更全、操作更為簡單的軟件滿足師生的需求。如果教師不能及時跟進,自己原有的方法和內(nèi)容很快就會落后——而學生一直都走在科技的最前沿,這也就造成了學生學習和教師教學之間出現(xiàn)新的間隔。最后,培訓對教師需求的定位不明。信息技術(shù)培訓和課程整合培訓完全是兩方面的培訓,教師有能力使用各種科技并不代表著他們有能力將各種科技整合進課程。這一點在移動學習上尤為明顯。3. 21世紀能力的缺失AT C 2 1 S 在2009年了21世紀學生所需要具備的十種能力,包括:(1) 創(chuàng)造和創(chuàng)新;(2)辯證思維、問題解決和決策;(3)學習如何去學習;(4)溝通;(5)合作;(6)信息讀寫能力;(7 )將技術(shù)作為工具進行研究的能力;(8)公民意識;(9)未來生活和職業(yè);(10)個人和社會責任。這些能力和移動學習息息相關(guān),甚至在某種程度上決定了移動學習的效果。

當我們進行移動學習時,免不了利用互聯(lián)網(wǎng)和相關(guān)軟件應(yīng)用搜尋需要的信息資料。在這個環(huán)節(jié)中,信息讀寫能力的作用就會體現(xiàn)出來。信息讀寫能力(Information Literacy)不僅僅包括了閱讀或輸入相關(guān)的信息,更包括了搜尋、定位、評估、過濾、創(chuàng)造、分享以及高效使用信息的能力。信息讀寫能力在過去的20年內(nèi)變化極大。試想在20年前,我們在圖書館中搜索信息,利用相關(guān)詞條在大范圍的索引中尋找信息,一旦在索引中搜尋到相關(guān)的信息,就可以直接定位,如果重復這一過程若干次,就能找到自己想要的信息。而在移動學習中,信息的搜尋變得極為困難——雖然信息的獲取變得更為簡單,但如何找到有效信息成為學習中的一大難題。當我們在搜索引擎中輸入一個或若干個

關(guān)鍵詞 ,如不是專有名詞,可能會得出數(shù)百萬條結(jié)果。顯然,逐條篩選這些結(jié)果是不現(xiàn)實的。這時,我們就需要利用信息讀寫能力幫助我們完成信息搜尋工作。在一般情況下,由于網(wǎng)絡(luò)環(huán)境中輸入信息的人員層次參差不齊,思維方式更是完全不同,對于相同信息的詮釋也就完全不同,甚至有些信息是完全錯誤的。在搜尋信息中如何過濾無效信息、評估并定位有效信息,對國內(nèi)學生來說是一個極大的挑戰(zhàn),對學生的辯證思維能力、問題解決能力和決策能力都是一種考驗(這些能力都是21世紀能力中的一部分),并且這些能力在學校中是很少被提及的。即便學生找尋到相關(guān)信息,如何將信息轉(zhuǎn)化并創(chuàng)造出自己和伙伴們能理解的內(nèi)容,也有很多的困難(假設(shè)我們不允許單純的信息復制)。

與此同時,由于國內(nèi)學生的學習主要為個人學習,很少在課堂外進行合作或溝通,在學生遇到信息讀寫困難時缺乏討論、反饋和互動的環(huán)境和行為(有些學生可能會用即時通訊工具相互詢問,但相關(guān)的討論耗時勞神且無正確結(jié)果的保證),使得提高信息讀寫能力更加困難。與此同時,學生對移動學習認知的局限性也讓他們失去了很多學習機會:學習不僅僅是觀看視頻,更是將過去和現(xiàn)在的信息進行關(guān)聯(lián)、分析和重復的過程。這也是21世紀能力中強調(diào)的學習如何學習的能力。

4. 移動學習的環(huán)境

目前國內(nèi)的中學生很多都有了自己的手機或平板電腦,家長對學生使用移動設(shè)備的管理力度也有所降低,但依然視移動設(shè)備尤其是智能手機和平板電腦為娛樂設(shè)備而非學習設(shè)備。在學校方面,管理者站在維護學校安全和穩(wěn)定的角度,限制學生使用移動設(shè)備。不可否認,缺乏自我管理能力的學生在擁有移動設(shè)備后的確可能影響學習,但更多的學生則會進行移動學習——他們搜索、創(chuàng)造和分享信息,溝通交流、存儲相關(guān)資料(很多學生的個人空間里都有如何學習各種科目或某知識點的相關(guān)資料)。不過,由于網(wǎng)絡(luò)的限制(大多數(shù)學校不提供無限網(wǎng)絡(luò)連接且手機數(shù)據(jù)流量較貴),他們無法隨時隨地連接網(wǎng)絡(luò)搜索資料支持自己的學習。缺乏了網(wǎng)絡(luò)支持的移動學習,移動學習的信息優(yōu)勢就難以體現(xiàn)。

5. 軟件應(yīng)用和軟件語言

在移動學習中,我們最常遇到的就是語言問題。我們常常能夠找到非常適合自己或?qū)W生學習的軟件應(yīng)用,卻因為語言不通而不得不放棄。比如,socrative就是一款非常優(yōu)秀的免費即時測驗軟件,但這款軟件沒有漢化版,甚至沒有推出漢化版的計劃。這也就意味著無論是教師還是學生,都必須懂得一些英語或其他語言,才能幫助學習繼續(xù)下去。這個問題在各個平臺上都很明顯。

國內(nèi)也有很多的軟件廠商開發(fā)各類學習軟件,但從TechEDGE中國子項目的研究來看,目前還沒有出現(xiàn)具備創(chuàng)新性和易用性的應(yīng)用。大多數(shù)的應(yīng)用都是和網(wǎng)站的學習內(nèi)容捆綁,在一定程度上限制了學生的信息讀寫能力和利用科技的研究能力。一些應(yīng)用只是學習網(wǎng)站的專屬瀏覽器或多媒體播放器,將移動設(shè)備變成了展示設(shè)備。也有一些軟件雖然轉(zhuǎn)為學習設(shè)計,卻忽略了學習的本質(zhì)。例如,一些背單詞軟件通過單詞對照表和不斷重復幫助學生完成英語學習。第二語言研究者早已通過實驗證明,通過單詞對照表學習單詞是不科學的和沒有輸出的。

如果無法解決語言和軟件應(yīng)用問題,移動學習在國內(nèi)的發(fā)展會受到限制,學生和教師都會丟失一些完成學習的機會,令移動學習的優(yōu)勢大打折扣。

結(jié)語

對于移動學習的未來,我們很難預(yù)測未來有什么變化,就像是十年前我們甚至不知道移動學習會真的有幫助一樣:設(shè)備的技術(shù)革新、軟件應(yīng)用開發(fā)的進步以及互聯(lián)網(wǎng)質(zhì)量的提高都會對移動學習的方式方法有著極大程度的影響。但有一點可以肯定:移動學習可以幫助學生提高學習成績,并幫助他們培養(yǎng)能力以適應(yīng)21世紀的需求。

第7篇:生物信息學培訓范文

相對于近些年轟轟烈烈的農(nóng)村中小學現(xiàn)代遠程教育和熱潮迭起的職業(yè)教育而言,2006年對于教育信息化,也許真的可以說今年無大事。經(jīng)過十多年從無到有的快速發(fā)展,教育行業(yè)信息化目前已進入相對平穩(wěn)的增長期。

但是,在無大事的表面現(xiàn)象之下,卻涌動著深層的新鮮的變化。這些來自第一線的變化,經(jīng)過了最初的浮躁,開始回歸理性,而且,也開始了真正意義上的探索。這都預(yù)示著,教育信息化已進入應(yīng)用轉(zhuǎn)型時期,教育行業(yè)用戶更多地開始考慮應(yīng)用的問題,在資金投入、系統(tǒng)建設(shè)和采購標準上日趨理性。無論是高校、職校還是中小學等,在重大應(yīng)用、資源建設(shè)、關(guān)鍵技術(shù)研究、縮小東西部數(shù)字鴻溝等等各個方面都有了跨越式的發(fā)展。

因為教育信息化啟動的步伐不一致,有的建設(shè)比較晚,但是起點比較高,建設(shè)的效果比較好;有的起步比較早,但是建設(shè)過程當中由于沒有統(tǒng)一標準,形成了很多的信息孤島,存在著很多問題。教育信息化很重要的問題就是資源的共享和整合,這是一個深層次管理問題,或者說是一個機制的問題。因此教育信息化的下一步工作就是機制、體制的進一步深化改革。教育信息化最終的目的是要用最小投入得到最大回報――怎么以最低的投入得到最大的回報,也就是性價比最好。而在信息化過程中,技術(shù)是一種手段,這條建設(shè)道路還會非常艱苦、漫長和曲折。

一 中國教育科研網(wǎng)格ChinaGrid項目完成

網(wǎng)格是繼傳統(tǒng)因特網(wǎng)、Web之后,信息革命的第三大浪潮。網(wǎng)格試圖實現(xiàn)互聯(lián)網(wǎng)上所有資源的全面連通,即把整個因特網(wǎng)整合成一臺巨大的超級計算機,實現(xiàn)計算資源、存儲資源、數(shù)據(jù)資源、信息資源、知識資源、專家資源等資源的全面共享。網(wǎng)格因此被看成是未來的互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)。網(wǎng)格研究的一個共同點是實現(xiàn)包括信息、知識在內(nèi)的各種資源的智能共享。

2006年9月,清華大學、北京大學等全國12所知名高校聯(lián)合承擔的教育部中國教育科研網(wǎng)格ChinaGrid項目宣告完成。經(jīng)過十多位專家近3年的聯(lián)合攻關(guān),該項目已整合了全國13個省市、20所重要高校的大量網(wǎng)格資源,聚合計算能力超過每秒16萬億次,存儲容量超過170TB,成為世界上最大的超級網(wǎng)格之一。

目前,項目組已成功開發(fā)和部署了生物信息學、圖像處理、計算流體力學、海量信息處理和大學課程在線等5類應(yīng)用網(wǎng)格。

點 評:

該項目把國家教育信息資源多快好省地整合起來,高效利用和共享。同時開發(fā)的網(wǎng)格中間件CGSP已經(jīng)受到國際組織高度關(guān)注,并且在引導著國際上ChinaGrid技術(shù)標準的形成。

二 國家基礎(chǔ)教育資源網(wǎng)上西部行活動正式啟動

資源是教育信息化建設(shè)的重中之重?,F(xiàn)在已初步形成了資源建設(shè)的有效機制。優(yōu)秀的資源正在往西部輸送。

2006年6月,國家基礎(chǔ)教育資源網(wǎng)上西部行活動正式啟動。這個活動是國家基礎(chǔ)教育資源共建共享聯(lián)盟與中國互聯(lián)網(wǎng)協(xié)會寬帶P2P應(yīng)用推進聯(lián)盟聯(lián)合舉辦的。活動從6月2日開始,到年底結(jié)束,為期7個月,主要面向新疆、內(nèi)蒙古、寧夏、貴州、江西、湖南、陜西、吉林等8個省(自治區(qū))的中小學教師及學生,利用先進的P2P技術(shù),將資源聯(lián)盟內(nèi)各知名學校的優(yōu)秀教育信息資源,無償傳送給急需這些資源的廣大師生,并且進行長期的內(nèi)容支持。

點 評:

利用互聯(lián)網(wǎng)新技術(shù)縮小數(shù)字鴻溝,為西部網(wǎng)絡(luò)教育建立一種創(chuàng)新的模式,讓西部的孩子們享受信息技術(shù)帶來的便利。這是一種新鮮的模式。

三 中小學教師新課程國家遠程培訓項目啟動

2006年8月,一次影響廣泛深遠的教師遠程培訓拉開了序幕?!?2班廣西鹿寨學員簽到、22班河南新密學員簽到、20班濟南歷城簽到……”隨著分布在28個省份的47個縣級教師培訓機構(gòu)通過視頻會議系統(tǒng)陸續(xù)向北京現(xiàn)場進行網(wǎng)上報到,教育部中小學教師新課程國家遠程培訓項目正式啟動。

這次培訓歷時半個月。培訓以解決基層教師在實施新課程過程中的問題和困惑為目標;課程內(nèi)容以案例為載體展開,盡可能通過不同年級不同學科的案例解答一線教師的困惑,聚焦新課程實施過程中的疑點、難點與重點,力求解決實際問題。

點 評:

由于嘗試采用了網(wǎng)絡(luò)視頻直播及文本閱讀等形式,打破了空間的限制,使得全國近萬名教師可以同時在線接受高質(zhì)量的培訓。這是一種大規(guī)模、高效益、低成本的教師培訓方式。

四 廣泛普及農(nóng)村中小學教學光盤的應(yīng)用

2006年5月,教育部向各地教育行政部門發(fā)出通知,要求廣泛普及教學光盤的應(yīng)用。通知指出,保證每套設(shè)備每周使用不少于20課時。要進一步增加教學光盤播放設(shè)備和成套教學光盤的配備,加大教學光盤和播放設(shè)備進教室的力度。工程招標結(jié)余資金主要用于為農(nóng)村小學和教學點增加配備電視機、DVD播放機和成套教學光盤,不得挪作他用。通知還強調(diào),要切實保證采購光盤的質(zhì)量。要采取公開招投標的方式采購教學光盤。

點 評:

廣泛普及教學光盤的應(yīng)用,將有力地緩解邊遠山區(qū)和貧困地區(qū)教育資源匱乏、教師不足和教育質(zhì)量不高的問題。

五 首個數(shù)字化學習港典型應(yīng)用示范學習中心運行

學習型的社會,離不開社區(qū)教育。社區(qū)教育是具有“全員”、“全程”、“全面”特點的區(qū)域教育,它能把教育延伸到社會基層,完成終身學習這樣的需求。

近幾年,社區(qū)教育正在風生水起,煥發(fā)出勃勃的生機。2006年9月,上海遠程教育系統(tǒng)落地楊浦區(qū)延吉新村街道,10萬居民可在居委會和地區(qū)圖書館任意選學各種課程。延吉街道黨工委書記樓滿信說:“投入30萬元讓10萬居民永久享用上億元的教育資源,太值了!”

2006年10月,全國首個數(shù)字化學習港典型應(yīng)用示范學習中心在天津市南開區(qū)水上街欣苑小區(qū)正式啟動運行。中心建有學習咨詢區(qū)、學習體驗區(qū)、休閑式的數(shù)字學習吧及多媒體視聽教室,共擁有100多臺數(shù)字學習終端,可以提供本??频榷鄬哟巍⒍嚅T類,上百個專業(yè)課程的遠程教育,并設(shè)置各類資格證書教育、繼續(xù)教育、勞動技能培訓,以及市民基本素養(yǎng)、化生活藝術(shù)、健康保健等社區(qū)居民教育課程。

第8篇:生物信息學培訓范文

關(guān)鍵詞 高級生物化學 教學 理論 創(chuàng)新 實踐 

中圖分類號:G424 文獻標識碼:A DOI:10.16400/j.cnki.kjdkx.2016.04.049 

在工科院校中,“高級生物化學”是微生物學、發(fā)酵工程和生化與分子生物學專業(yè)研究生的重要基礎(chǔ)課程,是連接“生物化學”和“分子生物學”的橋梁。它既是本科“生物化學”課程的提高和深華,又是研究生階段 “分子遺傳學”、“分子生物學”等課程的基礎(chǔ)。課程的目的是強化和拓寬研究生生物化學的基本理論知識,多角度地認識生物化學的基本原理和現(xiàn)象,并在此基礎(chǔ)上強化生物化學的實驗理論、技能和分析能力,為研究生研究實驗設(shè)計的合理性奠定基礎(chǔ)。在工科院校中,“高級生物化學”課程主要涉及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)合成與運輸、基因與基因組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學等章節(jié)的內(nèi)容。近年來,生物化學領(lǐng)域的新進展、新發(fā)現(xiàn)層出不窮,高級生物化學成為生命科學領(lǐng)域極其活躍的帶頭學科。對于一些應(yīng)用型的工科院校,高級生物化學課程將蛋白質(zhì)化學和組學相關(guān)的基礎(chǔ)理論及前沿進展傳授給學生,培養(yǎng)善于理論學習,長于工程實踐,勇于集成創(chuàng)新的應(yīng)用型生物技術(shù)人才。 

1教材中英文結(jié)合 

目前高級生物化學學科發(fā)展迅速,新知識新技術(shù)不斷更新?lián)Q代。目前唯一的高級生物化學教材是李關(guān)榮主編的高等學校規(guī)劃教材《高級生物化學》,①內(nèi)容涉及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能、尋靶、基因與染色體、基因技術(shù)、生物膜與跨膜轉(zhuǎn)運、生物信息轉(zhuǎn)導、基因表達調(diào)控、代謝調(diào)節(jié)策略等,偏重理論知識的講授。相對高級生物化學,生物化學課程的教材則很多,包括王鏡巖主編的《生物化學》②(高等教育出版社,2002年出版),于曉虹主編的《生物化學》③(浙江大學出版社,2012年出版,面向21世紀精品課程教材,全國高等醫(yī)藥教育規(guī)劃教材),劉國琴主編的《生物化學》④(中國農(nóng)業(yè)大學出版社,2011年出版)等。王鏡巖主編的《生物化學》內(nèi)容全面,講解細致,一直作為本科教學的典范,在本科院校的生物化學課程中廣泛采用,但作為工科院校的研究生教材,該教材一來與本科教學重復,二來內(nèi)容過于基礎(chǔ),缺乏前沿性。于曉虹主編的《生物化學》,內(nèi)容著重闡述人體基礎(chǔ)生物化學知識,為遠程專升本教材,內(nèi)容與本科教材有所區(qū)別,編寫著重符合這專升本學生的需要,不適合作為研究生的教材。劉國琴主編的《生物化學》是面向生物學專業(yè)本科生編寫的理科教材,內(nèi)容包括三部分:首先,重點討論了蛋白質(zhì)、核酸、酶、糖類和脂質(zhì)等生物大分子的結(jié)構(gòu)、功能以及結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系,同時介紹了這些生物大分子的重要生物化學性質(zhì)及相關(guān)分離、分析技術(shù)的基本原理和應(yīng)用特點;其次,對糖類、脂質(zhì)、氨基酸、核苷酸的分解代謝和合成代謝及其代謝調(diào)節(jié)進行了系統(tǒng)、概要介紹;最后,主要以原核生物為例討論了從DNA到RNA再到蛋白質(zhì)的遺傳信息流的分子機制。該教材內(nèi)容上和王鏡巖主編的《生物化學》有相似之處,適合選作生物學專業(yè)和生物技術(shù)專業(yè)教材,也適合生命科學相關(guān)學科,如醫(yī)藥、食品、農(nóng)林等領(lǐng)域本科生使用。 

除了以上教材,David Hames編著,王學敏等翻譯的《生物化學》⑤(第3版·中譯版)全書共13章,分別是:細胞結(jié)構(gòu)與成像、氨基酸與蛋白質(zhì)、酶、抗體、生物膜與細胞信號、DNA的結(jié)構(gòu)與復制、RNA合成與加工、蛋白質(zhì)合成、重組DNA技術(shù)、糖代謝、脂質(zhì)代謝、呼吸和能量、氮代謝。該書屬于精要速覽系列叢書,是國外暢銷教材,該書結(jié)構(gòu)新穎,視角獨特,重點明確,脈絡(luò)分明,圖表簡明清晰,適合作為工科院校研究生教材。同時,由于研究生教學對于英語的閱讀能力也具有較高要求,因此還可配合英文版作為課外閱讀教材,也便于雙語教學和國外客座教授的講學。 

2教學模式以啟發(fā)式引導為主線 

高級生物化學是一門抽象的學科,因此在教學中加入形象生動的flash動畫,使學生對生物化學相關(guān)蛋白質(zhì)、核酸等結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系、分子作用機理等概念的理解更為深入;同時通過大量生物化學相關(guān)小電影的優(yōu)美畫面引起學生對該課程的濃厚興趣。在課堂教學導入部分采用老師提問學生回答,通過案例進行啟發(fā)教學的模式,在此環(huán)節(jié),提問可引發(fā)學生自主思考,通過學生的各種答案教師引出需要講授的內(nèi)容,該方法可大大調(diào)動學生的學習積極性。在整個課堂教學中,摒棄傳統(tǒng)的以教為主的模式,把學放在首位,對特定原理的學習采用探究式教學的方法。 

在老師講解基礎(chǔ)知識的基礎(chǔ)上,引入課堂討論環(huán)節(jié),議題與生物化學基本理論和概念充分結(jié)合,與本學科的發(fā)展與應(yīng)用緊密聯(lián)系,通過對前沿問題的討論可激發(fā)學生的興趣并發(fā)揮主觀能動性,為進一步的深入學習奠定良好的基礎(chǔ)。在課堂討論環(huán)節(jié),老師可安排討論的題目供學生選擇,也可由學生根據(jù)興趣自由選題,然后公開宣講,老師和同學既是聽眾,也是討論的參與者,通過提問、討論和解決問題,拓寬學生的眼界和思路。老師應(yīng)及時對討論過程進行點評,一方面充分肯定學生顯示的創(chuàng)造性思維能力,一方面對思維中的不足進行糾正。課堂討論環(huán)節(jié)可培養(yǎng)學生創(chuàng)新創(chuàng)造、分析解決問題的能力,同時也促使老師自我知識不斷豐富和補充。 

與此同時,將學術(shù)報告引進課堂,每個班級的生物化學課程均邀請1~2位國內(nèi)外生物化學領(lǐng)域的知名專家為研究生做學術(shù)報告。這些多樣的學術(shù)報告,既讓研究生了解了生物化學學科的前沿進展,又讓學生有了學術(shù)交流的機會,還可培養(yǎng)學生的科研思維和科學精神。 

3充分利用網(wǎng)絡(luò)資源 

高級生物化學的發(fā)展日新月異,互聯(lián)網(wǎng)累積了海量的生物信息資源,將對我們的教學工作起到非常重要的作用。在高級生物化學課程的教學中強調(diào)互聯(lián)網(wǎng)資源運用的重要性,通過學生網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用的親身體驗喚起學生的求知欲,在課堂教學過程中,對常用數(shù)據(jù)庫進行介紹,提高學生信息收集和辨別的技巧和能力。例如,目前大多數(shù)的蛋白質(zhì)序列結(jié)構(gòu)和功能方面的信息都可以直接從網(wǎng)絡(luò)公共數(shù)據(jù)庫中得到,其中最常用的核苷酸序列數(shù)據(jù)庫包括GenBank、EMBL、DDBJ 等,這些數(shù)據(jù)庫中還同時包括了大量與序列直接相關(guān)的注釋信息,方便學生從中獲得需要的知識。另外,蛋白分析專家系統(tǒng)ExpertProtein Analysis System(簡稱ExPASy,http://expasy.ch,隸屬于瑞士生物信息學研究所,國際上蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)分子模型研究中心)可為用戶提供大量蛋白質(zhì)信息資源。因此,在高級生物化學的教學中首先詳細介紹一些數(shù)據(jù)庫的使用方法,再通過具體舉例使同學掌握基本的查詢方法和結(jié)果分析方法,并通過布置課后作業(yè),使學生通過自己的實踐更好地掌握數(shù)據(jù)庫的運用方法。 

4開放式實踐教學貫穿始終 

高級生物化學的理論知識相對比較抽象,對于初涉該專業(yè)的研究生而言較難理解,在理論教學中穿插大量實例是達到良好教學效果的必由之路。首先在教學過程中加入教師親身經(jīng)歷的實驗事例,例如根據(jù)工科院校背景重點講解酶制劑的分子改造實例,使學生通過實例學習更好地掌握該課程的精髓,提高分析解決實際問題的能力。 

在實踐教學方面,由于在本科階段生物化學課程的講授中已按排了生物化學基本單元操作實驗,如蛋白質(zhì)的兩性反應(yīng)和等電點的測定、凝膠過濾層析測定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量、總含氮量的測定—微量凱氏定氮法、紫外分光光度法測定核酸含量、糖化型淀粉酶活力的測定及、酶作用的專一性、酶的激活和抑制、碘乙酸抑制糖酵解、底物濃度對酶活性的影響—蔗糖酶米氏常數(shù)的測定、蛋白酶活力的測定、酵母蔗糖酶的純化及其酶性質(zhì)的研究等。因此在高級生物化學的實踐教學中,不再安排單獨的實驗單元操作,而采取開放式實踐教學模式,即選定相關(guān)學院生物化學方面相關(guān)老師所在的實驗室作為開放實驗室,對有興趣的學生進行時間、空間、內(nèi)容和方法均開放的培訓,通過一些小實驗的自我設(shè)計和驗證激發(fā)學生的學習熱情,以達到更好的教學效果。同時通過開放性實驗,使研究生對于整個實驗的設(shè)計和操作更為理解,可為研究生進一步的課題選擇奠定基礎(chǔ)。 

5 結(jié)語 

第9篇:生物信息學培訓范文

同濟大學

位于上海的同濟大學,建筑學屬國家一級重點學科和國家級特色學科。該專業(yè)擁有一套與眾不同的藝術(shù)理念,不盲目跟風,教師團隊實力雄厚,在國內(nèi)建筑領(lǐng)域有一定的社會影響。報考該專業(yè)的學生要求具備一定的繪畫能力,學制五年。

土木工程原隸屬建設(shè)部,在橋梁、鋼結(jié)構(gòu)、混凝土結(jié)構(gòu)、地下建筑等方面云集了很多重量級專家。學生經(jīng)過一段時間的學習會掌握建筑工程、地下工程、橋梁工程、巖土工程、鐵路與城市鐵道工程等多方向的知識。

車輛工程在全國算得上是數(shù)一數(shù)二的,是國家級特色專業(yè),它下設(shè)6個方向,學生可以任選。在課程安排上,學生除了學習汽車專業(yè)知識(雙語教學)外,還必須掌握英語和德語。學校與多家企業(yè)、社會機構(gòu)設(shè)立了專項獎學金,國內(nèi)外的企業(yè)對該專業(yè)畢業(yè)生的需求非常大。 同濟大學的三好塢

臨床醫(yī)學有著百年的歷史,學校依然對其加大建設(shè)?,F(xiàn)與多所德國大學有著實質(zhì)性的合作,不斷提升醫(yī)療水平,提升軟硬實力。

藝術(shù)設(shè)計專業(yè)方向是環(huán)境藝術(shù)設(shè)計專業(yè)(同濟大學的優(yōu)勢專業(yè)),擁有雄厚的師資力量,常與同領(lǐng)域的各機構(gòu)合作密切。

德語專業(yè)實力較強,科技德語方向是特色,學生還需要學習高等數(shù)學、普通物理、機械識圖、計算機應(yīng)用等理工類基礎(chǔ)課程以及外貿(mào)、經(jīng)濟管理類相關(guān)課程。

北京郵電大學

北郵由單一的郵電學院發(fā)展成現(xiàn)在的綜合性大學,形成了完整的電信類學科群,在郵電、通信領(lǐng)域,絕對是一塊金字招牌。

電子工程學院的電子科學與技術(shù)、電子信息科學與技術(shù)、光信息科學與技術(shù)三個本科專業(yè)社會需求較大,頗受社會和用人單位的歡迎,就業(yè)率位居全校第一。

信息工程學院和許多大公司聯(lián)合建立實驗室,與法國電信北京研發(fā)中心、美國ADI公司、天津移動等建立了良好的合作關(guān)系。

計算機學院在寬帶網(wǎng)絡(luò)方面非常出名,以通信軟件為特色,計算機技術(shù)(軟件、硬件和網(wǎng)絡(luò))與通信技術(shù)相結(jié)合,也是響當當?shù)?,每年許多大公司都會來這里招人。

此外,學校還有一些綜合性的特色專業(yè),像經(jīng)管、文法、英語等,這些具備通信背景的學科在社會上也是很有競爭力的,在電信法、電信產(chǎn)業(yè)經(jīng)濟等方面也都有很深入的研究,以電信產(chǎn)業(yè)為依托發(fā)展自己的長項。

天津大學

建筑學專業(yè)在國內(nèi)國際上都可堪稱是一流的,是綜合研究建筑、建筑群、室內(nèi)外環(huán)境等方面的學科,培養(yǎng)學生不僅能打造出科學的建筑,而且能打造出藝術(shù)的建筑。它是該學科目前全國僅有的3個重點學科之一。教學亮點是挑選部分高考成績非常突出的學生,單獨組成一個班進行為期一年的集別培訓,一年以后學生可以根據(jù)自己的喜好和特點自主選擇任何專業(yè)。

天津大學化工學院的專業(yè)特色方向是現(xiàn)代傳質(zhì)理論與分離工程、生物信息學與生物化工、新型催化材料與反應(yīng)工程、綠色化學新工藝與產(chǎn)品工程等。 天津大學的北洋大學堂紀念亭

測控技術(shù)與儀器專業(yè)屬國家特色學科,十分注重對學生實踐能力的培養(yǎng),擁有數(shù)臺價值上千萬元的現(xiàn)代化先進儀器設(shè)備和國內(nèi)一流實驗室,設(shè)有現(xiàn)代化的“精密測試技術(shù)及儀器國家重點實驗室”。

華北電力大學

學校校部設(shè)在北京,分設(shè)保定校區(qū),兩地實行一體化管理。

現(xiàn)擁有熱能工程、電力系統(tǒng)及其自動化2個國家重點學科,核工程與核技術(shù)、自動化、工商管理3個國家特色學科。其中電氣工程及其自動化、動力工程和自動化控制學科是華北電力大學最具特色的學科。電氣工程及其自動化本科設(shè)電力系統(tǒng)及其自動化(電力)等6個專業(yè)方向,是我國電力人才的重點培養(yǎng)基地,畢業(yè)生大部分都投身于我國的電力事業(yè),就業(yè)前景良好。

動力工程主要與大型汽輪發(fā)電機組、節(jié)能理論技術(shù)、新能源和新能量轉(zhuǎn)換、狀態(tài)檢修等領(lǐng)域的科學和技術(shù)打交道,從這個專業(yè)學到的知識可以廣泛運用在各大發(fā)電廠、供電輸電單位,畢業(yè)生就業(yè)形勢不錯。

自動化控制是能源與動力工程學院的品牌專業(yè),學生畢業(yè)后主要從事程序控制、運動控制、過程控制等工作,學院不僅注重對學生知識能力的培養(yǎng),而且還特別重視培養(yǎng)學生的專業(yè)技術(shù)解決能力。

電子科技大學

電子科技大學位于成都,通信學院是電子科大最牛的學院,除了它本身師資力量雄厚外,實驗室就撐起了“半壁江山”,其中寬帶光纖傳輸與通信系統(tǒng)技術(shù)國家重點實驗室籌建于1990年,中國的海底光纜多半都是出自這個實驗室的研究成果。該學院下屬的通信工程專業(yè)被評為第一批特色專業(yè)。

電子工程學院是電子科大成立最早規(guī)模最大的學院。學院的微波工程系、電子工程系、信息工程系許多老師都在意大利宇航局、德國慕尼黑大學、美國Intel公司等交流過。這個學科的人很容易進入各大通信公司、手機生產(chǎn)商。

光電信息學院在光通信、光纖傳感等方面獨步“武林”,每年都有西門子、強生等大公司來招聘人才,也和四個部省級重點實驗室以及一個工程中心有聯(lián)系。許多同學研究各種醫(yī)療器械,比如心電圖儀、內(nèi)窺鏡子類等。不要小看這些東西,在電子儀器里,這一塊的利潤超過手機和相機,而且市場巨大。

西安電子科技大學以信息與電子學科為主,是全國37所示范性軟件學院的高校之一,也是全國20所獲批設(shè)立集成電路人才培養(yǎng)基地的高校之一。

西安電子科技大學特色專業(yè):通信工程、信息安全、網(wǎng)絡(luò)工程、集成電路設(shè)計與集成系統(tǒng)、軟件工程(嵌入式系統(tǒng)方向)、軟件工程(WEB工程與信息系統(tǒng)方向)、電子信息工程、微電子學、計算機科學與技術(shù)、智能科學與技術(shù)、機械設(shè)計制造及其自動化、電子信息科學與技術(shù)、電子科學與技術(shù)、電磁場與無線技術(shù)和電子封裝技術(shù)。

東北大學

東北大學座落在沈陽,材料與冶金學院是國家重點建設(shè)學院,設(shè)有軋鋼技術(shù)與連軋自動化國家重點實驗室等,冶金工程、材料科學與工程是首批國家一級重點學科,所覆蓋的二級學科均為國家重點學科。

軟件學院設(shè)有軟件工程、信息安全兩個專業(yè)。一些信譽好的IT認證課程已納入課程體系,學生通過認證考試既可獲得獎勵學分,又可獲得獎勵補貼,專業(yè)課程雙語教學比例達到 60%以上。

裝備制造業(yè)在國內(nèi)具有很大影響,畢業(yè)生可以從事多領(lǐng)域的研究和建設(shè)。 東北大學的校標取“白山黑水”之意

日語專業(yè)從對日語的聽、說、讀、寫、譯全面掌握,到熟悉日本文化、社會,畢業(yè)后,除了攻讀研究生外,還可以到外經(jīng)貿(mào)部門與企業(yè)就職。

礦工程專業(yè)是國家重點學科,采礦工程實驗室是遼寧省重點實驗室。作為該專業(yè)的畢業(yè)生,同樣可在深造和就業(yè)兩個方向上,根據(jù)自身條件加以選擇。

冶金工程在眾多開設(shè)冶金工程專業(yè)的院校中,算是資歷、實力最強的了,是國家一級重點學科。學生有獲得“專業(yè)獎學金”的機會,就業(yè)率很高。

河海大學

河海大學位于南京,水利水電學院是我國水利學科專業(yè)設(shè)置歷史悠久、水利特色最為顯著的學院,是國家一級重點學科,在三峽、小浪底、南水北調(diào)等重大工程中,都有河海大學水利工程學的優(yōu)秀學子的參與。

土木工程是河海大學的另一個傳統(tǒng)優(yōu)勢專業(yè),在國際國內(nèi)都頗有影響,擁有一批國內(nèi)外知名的專家學者,參與國家重大科研項目不計其數(shù),足可見其雄厚的學科實力。

港口航道與海岸工程是河海大學和江蘇省的品牌專業(yè),也是這個學校一直以來就業(yè)率很高的專業(yè)之一,就業(yè)領(lǐng)域十分廣泛。

水文與水資源工程擁有水文水資源與水利工程科學國家重點實驗室,以及由多名院士、教授、博導組成的雄厚的師資隊伍。

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